授業コード 50006312 単位数 4
科目名 卒業研究 クラス 12
履修期 年間授業 カリキュラム ＊下表参考
担当者 岡西　政典 配当年次 ＊下表参考
授業の題目 卒業研究：海産無脊椎動物の分類学的研究
Graduation Research: Taxonomic Study of Marine Invertebrates
学修の概要 本科目では，海産無脊椎動物を対象に，標本にもとづく分類学研究を一年間かけて遂行する．テーマは各自が設定し，材料の確保（採集・借用・既存コレクションの利用），形態観察（形質抽出，計測，図版作成），文献・データベース調査（原記載・改訂・同物異名の検討）を行う．必要に応じてDNA情報を取得し，系統解析等を通じて同定・分類学的判断の根拠を補強する．最終成果として，分類学的根拠が追跡可能な卒業論文（本文＋図表＋付録データ）を完成させる．
学修の到達目標 １．海産無脊椎動物の同定を，形態形質と文献根拠にもとづいて説明できる．
２．観察データ（形態・画像・配列等）を再現可能な形式で整理し，根拠にもとづく分類学的結論を導ける．
３．記載・比較・系統推定の基本的作法を理解し，学術論文形式で研究成果を文章化できる．
４．標本・データの取扱い（ラベル情報，採集記録，引用・著作権，研究倫理）を遵守して研究を進められる．
授業計画 第１回 ガイダンス：研究の進め方，安全・倫理，標本取扱いとデータ管理の約束事
→ 研究倫理・安全，研究ノートとデータ管理の基本，年間の進め方を理解する．
第２回 分類群の基礎整理：対象群の概説，主要な同定形質，参考図鑑・キーの使い方
→ 対象群の主要形質を説明でき，キーや図鑑で同定の入口に立てる．
第３回 原記載を読む：タイプ概念，記載論文の読み解き，必要情報の抜き出し
→ 原記載から標徴形質・産地・タイプ情報を抽出し，要点を整理できる．
第４回 研究テーマ案の設計：対象群×材料×問い（未整理群／地域差／近縁種比較など）
→ 研究の「問い」を文章化し，材料・方法・成果の見通しを立てられる．
第５回 材料と到達目標の確定：標本・写真・配列等の入手可能性と研究範囲の再設定
→ 到達可能なスコープに絞り，評価可能な目標（アウトプット）を定義できる．
第６回 研究プロトコル作成：観察項目，計測法，撮影条件，記録様式（再現性の担保）
→ 再現性ある観察・記録手順（プロトコル）を自分で設計できる．
第７回 研究計画書の提出：材料一覧，工程表，必要機材，想定アウトプット
→ 工程表・材料一覧・必要資源を含む研究計画書を作成できる．
第８回 標本調査①：ラベル情報の整備，採集・来歴情報の標準化（例：地点，深度，日付）
→ 標本情報を標準形式で整理し，追跡可能な記録（メタデータ）を整備できる．
第９回 標本調査②：形態観察の実装（解剖・観察・計測），写真図版の基本設計
→ 観察・計測・撮影を実施し，図版の構成案を作れる．
第１０回 比較の作法：近縁種比較の組み立て（診断形質，変異，成長段階，保存状態の影響）
→ 何を比較すべきか（形質・変異・保存影響）を踏まえ，比較枠組みを立てられる．
第１１回 分子データ導入の判断：目的に応じたDNA利用（バーコーディング／系統推定／集団差）
→ 分子データが必要かどうかを研究目的から判断し，利用方針を説明できる．
第１２回 データ整形①：計測表・形質表・画像管理（ファイル命名，メタデータ，バックアップ）
→ データを破綻しない形で管理（命名規則，表形式，バックアップ）できる．
第１３回 データ整形②：分布・産地情報の可視化（地図化，深度帯整理，採集努力の偏り確認）
→ 産地・深度などを整理し，分布の特徴や偏りを読み取れる．
第１４回 中間報告①：問題設定と材料の妥当性
→ 研究目的・材料・方法を他者に説明し，指摘を受けて修正できる．
第１５回 中間報告②：観察結果の速報と課題検討
→ 暫定結果を要点化し，次に潰すべき課題を明確化できる．
第１６回 中間報告③：同定仮説・比較計画の再調整
→ 同定仮説を言語化し，代替仮説も含めた比較計画に落とし込める．
第１７回 解析①：形態データの扱い（変異の見積り，図表化，必要に応じて統計の基礎）
→ 形態データを図表にまとめ，変異の扱い（個体差／種差）を説明できる．
第１８回 解析②：配列データの基礎（アラインメント，距離，系統樹推定の読み方）
→ 系統解析結果を読み，支持値や距離の意味を基本レベルで解釈できる．
第１９回 解析③：結果の統合（形態×分子×文献根拠の整合性チェック）
→ 複数証拠の整合性を点検し，結論の強さ／弱さを見積もれる．
第２０回 分類学的結論の整理：同定根拠の明文化，未解決点と代替仮説の提示
→ 同定・分類判断の根拠を文章化し，未解決点を適切に残せる．
第２１回 執筆①：材料・方法の書き方（再現可能性，標本情報，データ公開の書式）
→ 方法を第三者が追試できる形で書ける（標本情報・手順・解析条件）．
第２２回 執筆②：結果の示し方（診断記載，図版，表，系統樹，分布）
→ 結果を「図表＋文章」で過不足なく提示できる（診断・比較の要点化）．
第２３回 執筆③：序論・考察（既往研究との位置づけ，分類学的意義，今後の課題）
→ 既往研究に位置づけ，意義と限界を踏まえた考察を書ける．
第２４回 原稿作成①：本文初稿の提出（構成チェックと改稿計画の策定）
→ 論文全体の骨格を作り，論理の穴を自己点検できる．
第２５回 原稿作成②：図表・付録データの完成（測定表，標本リスト，配列情報等）
→ 図版・表・付録（標本リスト等）を整え，本文との整合を取れる．
第２６回 原稿作成③：最終稿に向けた推敲（用語統一，引用整備，論理の飛躍の除去）
→ 学術文体としての品質（用語，引用，根拠の明示）を仕上げられる．
第２７回 最終発表①：研究の要点と根拠提示
→ 研究の核心（問い・根拠・結論）を短時間で論理的に説明できる．
第２８回 最終発表②：研究の要点と根拠提示
→ 質疑を通じて結論の妥当性を再確認し，反映点を抽出できる．
第２９回 最終発表③：研究の要点と根拠提示
→ 指摘を受けて最終稿に反映する優先順位を付けられる．
第３０回 提出・総括：最終版提出，データ保全（再利用可能な形での納品）
→ 成果物を規定形式で提出し，データと記録を再利用可能な形で整理できる．
授業外学習の課題 毎週，研究ノートを更新し，進捗・判断根拠・次の作業を記録すること．加えて，対象群に関連する一次文献（原記載，改訂，レビュー）を計画的に読み，毎回「要点（何が分かったか）」「未解決点（何が分からないか）」「自分の研究への影響（何を変えるか）」の3点で短く整理すること．
履修上の注意事項 ・遅刻・欠席の扱いは大学の規程に従う．
・実験・観察・標本取扱いに伴う安全管理を徹底し，採集・借用標本の扱い，画像・データの引用，研究倫理を遵守すること．
・1論文の精査には1-2時間程度かけること
・学期末に卒業データを提出する．
・公認欠席は単位認定要件には影響しないよう配慮する．
成績評価の方法・基準 卒業論文（本文の論理性・分類学的根拠の明確さ・図表と付録の整合性）を中心に評価する（100％）．希望者には講評を返す．
テキスト 指定しない
参考文献 海産無脊椎動物の分類学・系統分類学に関する学術誌（例：Zootaxa，ZooKeys，Systematics and Biodiversity，Marine Biodiversity，Species Diversity ほか）
（加えて，国際命名規約，主要データベース・同定キー等を適宜参照する）
主な関連科目 生物学，生物情報と環境，生命科学，生物調査実習，環境ゼミナールa, b
オフィスアワー及び
質問・相談への対応		 随時受け付ける（メール等:mokanish@shudo-u.ac.jp）
■カリキュラム情報
所属 ナンバリングコード 適用入学年度 配当年次 身につく能力
知識・技能 思考力 判断力 表現力 協創力
人間環境学部人間環境学科（ゼミナール科目） FHES47101 2018～2021 4 - - - - -