| 授業コード | 50028200 | 単位数 | 1 |
| 科目名 | 生物観察の基礎ｂ | クラス | |
| 履修期 | 前期授業 | カリキュラム | ＊下表参考 |
| 担当者 | 岡西 政典 | 配当年次 | ＊下表参考 |
| 授業の題目 | 分子生物学の基礎：DNA抽出、PCR、ダイレクトシーケンス、系統解析まで |
| 学修の概要 | 近年、DNAレベルの目に見えないミクロなサイズの生物学の発展は、我々に大きな恩恵をもたらしている。代表的な例では新型コロナウイルスの検出で注目を浴びたPCR法があるが、一方でこのような原理の説明は一般にはなされていない。実際にはPCR法は医学だけでなく生物学の様々な分野で用いられている。そこで本講義では、現代の生物学を知る上で不可欠なこのPCR法について、その原理を学びつつ、実際の生物サンプルを用いて実験手法を学ぶ。 |
| 学修の到達目標 | ・PCR、ダイレクトシーケンスなどの分子生物学的手法を説明できるようになる ・以上の手法を実践するための実験手法を習得する ・PCを用いた塩基配列の解析法の基礎を習得する" |
| 授業計画 | 第１回 | 講義ガイダンス：実習の概要説明（PCR, ダイレクトシーケンスについて） |
| 第２回 | 分子実験手法の基礎I：実験ノートの取り方・ピペットマン操作 | |
| 第３回 | 分子実験手法の基礎II：遠心機、恒温器、サーマルサイクラーの操作 | |
| 第４回 | DNA抽出I：サンプルの選定・組織の切り出し | |
| 第５回 | DNA抽出II：試薬混合・ホモジェナイズ・インキュベート | |
| 第６回 | PCR I：酵素の取り扱い・試薬混合 | |
| 第７回 | PCR II：サーマルサイクラーのプログラミング | |
| 第８回 | PCR III：アガロースゲルの作成 | |
| 第９回 | PCR IV：アガロースゲル電気泳動 | |
| 第１０回 | PCR V：DNA精製 | |
| 第１１回 | DNA解析法の基礎講義 | |
| 第１２回 | DNA解析演習I：波形の読み取り | |
| 第１３回 | DNA解析演習II：塩基配列（Fastaファイル）の作成 | |
| 第１４回 | DNA解析演習III：DNAアライメント | |
| 第１５回 | DNA解析演習IV：分子系統樹の作成 |
| 授業外学習の課題 | ・事前に参考文献を調べて，授業内容を予習すること． ・毎実習につき1時間程度の予習，実習後1時間程度の復習を期待する． |
| 履修上の注意事項 | ・本講義は生命科学」「生物学」「総合教養講義a(動物の自然史と分類）」と深く関係するため，同時履修でも構わないので，このいずれかの科目を履修しておくことが望ましい． ・各講義に連続性があり，全員で共同作業を行う「実習形式」である． ・実習にあたっては高価な試薬を用いるため，原則欠席や遅刻は許されない． ・目に見えないほどの微量の液体を、高価な実験器具を用いて行うため、失敗しないよう高度な集中力を要する． ・いわゆる「理系」の科目であり、時間が限られた中で論理的な思考を持って取り組む必要がある． ・公認欠席は単位認定要件には影響しないよう配慮する． 以上のことを十分理解した上で実習に臨むこと． |
| 成績評価の方法・基準 | 実習への参加・取り組み（70%），レポート（30%）によって総合的に評価する． レポートの返却は希望に応じて行う． |
| テキスト | テキストは使用せず，Moodleなどを通じて毎回資料を配信する． |
| 参考文献 | 「分子系統学への統計的アプローチ」Zieng Yang 著, 藤博幸，加藤和貴，大安裕美 訳，共立出版 |
| 主な関連科目 | 「生命科学」「生物学」「総合教養講義a(動物の自然史と分類）」 |
| オフィスアワー及び 質問・相談への対応 |
講義中や講義終了後を含めて、質問については常に受け付ける．もしくは担当者宛メール（mokanish@shudo-u.ac.jp）にて対応する |
| 5 | 4 | 3 | 2 | 1 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 課題への取り組み | 課題への取り組み・成果が極めて優秀であり，非の打ち所がない | 課題に対して的確かつ網羅的に取り組んでいる | 課題に対して一通り取り組んでいる | 課題に対する取り組みが不十分である | 課題に全く取り組んでいない |
| 所属 | ナンバリングコード | 適用入学年度 | 配当年次 | 身につく能力 | ||||
| 知識・技能 | 思考力 | 判断力 | 表現力 | 協創力 | ||||
| 人間環境学部人間環境学科（フィールド科目） | FHES16106 | 2023～2023 | 1・2・3・4 | ○ | ○ | ○ | ○ | ○ |
| 人間環境学部人間環境学科（フィールド科目） | 51300 | 2024～2024 | 1・2・3・4 | ○ | ○ | ○ | ○ | ○ |