| 授業コード | 50028200 | クラス | |
| 科目名 | 生物観察の基礎ｂ | 単位数 | 1 |
| 担当者 | 岡西 政典 | 履修期 | 前期授業 |
| カリキュラム | ＊下表参考 | 配当年次 | ＊下表参考 |
| 授業題目 | 分子生物学の基礎：DNA抽出、PCR、ダイレクトシーケンス、系統解析まで |
| 授業の概要 | 近年、DNAレベルの目に見えないミクロなサイズの生物学の発展は、我々に大きな恩恵をもたらしている。代表的な例では新型コロナウイルスの検出で注目を浴びたPCR法があるが、一方でこのような原理の説明は一般にはなされていない。実際にはPCR法は医学だけでなく生物学の様々な分野で用いられている。そこで本講義では、現代の生物学を知る上で不可欠なこのPCR法について、その原理を学びつつ、実際の生物サンプルを用いて実験手法を学ぶ。 |
| 学習の到達目標 | "・PCR、ダイレクトシーケンスなどの分子生物学的手法を説明できるようになる ・以上の手法を実践するための実験手法を習得する ・PCを用いた塩基配列の解析法の基礎を習得する" |
| 授業計画 | 第１回 | 8/21 (月)1限目 講義ガイダンス：実習の概要説明（PCR, ダイレクトシーケンスについて） |
| 第２回 | 8/21 (月)2限目 分子実験手法の基礎I：実験ノートの取り方・ピペットマン操作 | |
| 第３回 | 8/21 (月)3限目 分子実験手法の基礎II：遠心機、恒温器、サーマルサイクラーの操作 | |
| 第４回 | 8/21 (月)4限目 DNA抽出I：サンプルの選定・組織の切り出し | |
| 第５回 | 8/21 (月)5限目 DNA抽出II：試薬混合・ホモジェナイズ・インキュベート | |
| 第６回 | 8/22 (火)1限目 PCR I：酵素の取り扱い・試薬混合 | |
| 第７回 | 8/22 (火)2限目 PCR II：サーマルサイクラーのプログラミング | |
| 第８回 | 8/22 (火)3限目 PCR III：アガロースゲルの作成 | |
| 第９回 | 8/22 (火)4限目 PCR IV：アガロースゲル電気泳動 | |
| 第１０回 | 8/22 (火)5限目 PCR V：DNA精製 | |
| 第１１回 | 8/24 (木)1限目 DNA解析法の基礎講義 | |
| 第１２回 | 8/24 (木)2限目 DNA解析演習I：波形の読み取り | |
| 第１３回 | 8/24 (木)3限目 DNA解析演習II：塩基配列（Fastaファイル）の作成 | |
| 第１４回 | 8/24 (木)4限目 DNA解析演習III：DNAアライメント | |
| 第１５回 | 8/24 (木)5限目 DNA解析演習IV：分子系統樹の作成 |
| 授業外学習の課題 | ・事前に参考文献を調べて，授業内容を予習すること． |
| 履修上の注意事項 | "・本講義は対面講義として、8/21(月), 8/22（火）、8/24（木）の3日間で実施する． ・本講義は生命科学」「生物学」「総合教養講義a(動物の自然史と分類）」と深く関係するため，同時履修でも構わないので，このいずれかの科目を履修しておくことが望ましい． ・各講義に連続性があり，全員で共同作業を行う「実習形式」である． ・実習にあたっては高価な試薬を用いるため，原則欠席や遅刻は許されない． ・目に見えないほどの微量の液体を、高価な実験器具を用いて行うため、失敗しないよう高度な集中力を要する． ・いわゆる「理系」の科目であり、時間が限られた中で論理的な思考を持って取り組む必要がある． 以上のことを十分理解した上で実習に臨むこと．" |
| 成績評価の方法・基準 | プロジェクトへの参加・取り組み（70%），レポート（30%）によって総合的に評価する． |
| テキスト | テキストは使用せず，Moodleなどを通じて毎回資料を配信する． |
| 参考文献 | 「分子系統学への統計的アプローチ」Zieng Yang 著, 藤博幸，加藤和貴，大安裕美 訳，共立出版 |
| 主な関連科目 | 「生命科学」「生物学」「総合教養講義a(動物の自然史と分類）」 |
| オフィスアワー及び 質問・相談への対応 |
講義中や講義終了後を含めて、質問については常に受け付ける．もしくは担当者宛メール（mokanish@shudo-u.ac.jp）にて対応する |
| 所属 | ナンバリングコード | 適用入学年度 | 配当年次 |
| 人間環境学部人間環境学科（フィールド科目） | FHES16106 | 2023～2023 | 1・2・3・4 |